Для диагностики этого заболевания необходим сбор анамнеза, сведения которого должны быть исчерпывающими и касаться вопросов питания и другой полезной информации. Важно учитывать и клинические признаки, наличие которых может помочь в постановке диагноза. Проведение дополнительных исследований является необходимым в случае остро протекающего или хронического рецидивирующего колита. Обзорная рентгенография брюшной полости (для исключения других причин возникновения симптомов), ректальное обследование, взятие крови (клинический анализ крови) – все это должно быть проведено при первом осмотре у ветеринарного врача. Для постановки точного диагноза (особенно в случае рецидивирования) также важным является проведение эндоскопии – колоноскопии, во время которой необходимо взятие биоптата – кусочка слизистой оболочки толстой кишки.
Бактериологическое и гельминтологическое исследования кала нужны для исключения инфекционной и паразитарной составляющей этиологии колита. Анализ кала на простейших позволит выяснить, не являются ли они причиной возникновения воспалительного процесса или сопутствующим звеном при другой основной причине.