Симптомы нокардиоза зависят от преимущественного поражения тех или иных органов и тканей (т.е. формы заболевания). Поражения кожи включают в себя изъязвления, часто глубокие (затрагивается подкожная клетчатка). Также могут быть увеличены регионарные лимфатические узлы. При затрагивании патологическим процессом плевры и легких регистрируется проявление таких симптомов как кашель (часто влажный, с выделением гноя с примесью крови, возможны и выделения из носовой полости), одышка, угнетение и снижение толерантности к физическим нагрузкам, гипертермия – повышение температуры тела, анорексия и кахексия (отсутствие аппетита и снижение массы тела, соответственно). Описанные выше неспецифические симптомы наблюдаются и при других формах заболевания.
Также может происходить распространение инфекции на костную ткань. При поражении костей конечностей наблюдается хромота, изменении в конфигурации позвонков – неврологические симптомы компрессии спинного мозга. Так, при первой степени неврологического дефицита единственным симптомом является боль, нарушения функции конечностей не происходит. Вторая степень также характеризуется болезненностью, а также слабостью конечностей (тазовых) при сохраненной способности ходить, которая отсутствует при третьей степени. Четвертая степень неврологических расстройств – паралич с сохранением глубокой болевой чувствительности. Последняя не наблюдается при пятой степени (иногда выделяют и шестую – с отсутствием глубокой болевой чувствительности на протяжении более чем 12 часов). Также может быть отмечено недержание мочи и кала.
При поражении непосредственно нервной системы также наблюдаются симптомы неврологического дефицита (для спинного мозга – описаны выше). Распространение инфекции в головной мозг может стать причиной атаксии (нарушения координации движений), нистагма, судорог и комы. Судорожный синдром иногда прогрессирует до эпилептического статуса, характеризующегося продолжительными припадками с коротким интервалом между ними (прогностически неблагоприятные симптомы). Кома может развиться как после периода судорог, так и без него. Иногда инфекционный процесс затрагивает печень, желудочно-кишечный тракт, почки и другие органы с образованием в них абсцессов и проявлением соответствующих нарушению функционирования этих органов симптомов.