Диагностика сальмонеллеза представляется сложной ввиду того, что клиническая картина этого заболевания сходна с таковой при многих других болезнях. Дифференциальная диагностика проводится с бактериальными, вирусными, грибковыми, паразитарными инфекциями, которые могут вызывать симптомы нарушения работы желудочно-кишечного тракта (кампилобактериоз, парвовирусный и коронавирусный энтерит, инфекционный гепатит собак, кокцидиоз, гиардиоз, инвазия круглыми червями, геморрагический гастроэнтерит, панкреатит, пищевая гиперчувствительность, инвагинация, почечная недостаточность, неинфекционные заболевания печени, другие системные болезни).
В том случае, если наблюдаются нарушения воспроизводства, необходимо исключить другие возможные причины этого – так, аборты могут наблюдаться при бруцеллезе, токсплазмозе, герпесвирусной инфекции, применении препаратов, вызывающих нарушение развития и смерть плодов, некоторых неинфекционных заболеваниях.
После получения данных анамнеза (может иметься информация о содержании животного в ненадлежащих условиях, возможности употребления им в пищу некачественных продуктов) и проведения клинического осмотра рекомендуются следующие лабораторные и инструментальные исследования: общий и биохимический анализы крови, общий анализ мочи, бактериологическое исследование кала, а при наличии симптомов септицемии – и крови, рентгенологическое и ультразвуковое исследование
В общем анализе крови могут быть отмечены анемия – снижение количества эритроцитов (особенно характерно в том случае, если наблюдается диарея или рвота с кровью), лейкопения или лейкоцитоз (снижение или увеличение количества лейкоцитов, соответственно). Изменения показателей биохимического профиля неспецифичны и могут быть полезны для установления каких-либо иных причин развития симптомов гастроэнтерита, например, почечной недостаточности, воспалительного процесса в печени или поджелудочной железе.
В общем анализе мочи возможно изменение показателей, связанное с хронической почечной недостаточностью, при которой также наблюдаются рвота, диарея и неспецифические симптомы – угнетение, анорексия и кахексия, характерные и для сальмонеллеза (снижение плотности мочи в результате понижения скорости клубочковой фильтрации по причине необратимых изменений структурных единиц почек).
Инструментальные исследования (рентгенографическое, в том числе контрастное, а также ультразвуковое) проводятся для того, чтобы исключить некоторые диагностируемые таким путем патологии, в том числе непроходимость кишечника вследствие роста новообразования или наличия инородного тела (если присутствует неукротимая рвота), инвагинацию.
Серологическая и/или ПЦР-диагностика могут быть полезны для исключения некоторых заболеваний с похожей симптоматикой (бактериальных и вирусных инфекций, например, парвовирусного энтерита или панлейкопении, коронавирусного энтерита, лептоспироза, герпесвирусной инфекции, бруцеллеза, токсоплазмоза и других). Подтверждение диагноза проводится при помощи бактериологических исследований крови и кала.