Трихоскопия используется в диагностике дерматофитии – под микроскопом можно обнаружить волосы, пораженные грибковой инфекцией. Также посредством трихоскопии можно определить, является ли алопеция самоиндуцированной (вызванной зудом и вылизыванием/расчесыванием) или же не связана с механическим воздействием.
Трихоскопия проводится и при подозрении на демодекоз, т.к. клещи часто обнаруживаются при микроскопии корней волос.