Диагностика калицивироза проводится при помощи сопоставления результатов клинического осмотра и лабораторных исследований. Общему осмотру должно предшествовать получение данных анамнеза (возраст, пол, информация о проведении вакцинации – когда? какой вакциной?, условиях содержания – единственное ли животное в доме? если совместно находятся и другие кошки – есть ли у них какие-либо клинические признаки заболевания? вакцинированы ли они?). Затем ветеринарный врач оценивает общее состояние животного и наличие или отсутствие характерных для тех или иных заболеваний, в том числе калицивироза, признаков.
После клинического осмотра проводится получение материала для лабораторных исследований. Как правило, необходимы общий и биохимический анализы крови, изменения в которых не являются специфическими, но позволяют оценить тяжесть состояния животного и определить тактику лечения. Также может быть проведена ПЦР-диагностика, с помощью которой возможно поставить точный диагноз и выявить сопутствующие инфекционные заболевания, если они присутствуют – так, нередко совместно с тяжело протекающей калицивирусной инфекцией обнаруживается вирусный лейкоз кошек или же вирусный иммунодефицит кошек. При наличии симптомов пневмонии необходимо рентгенологическое исследование.