Диагностика описторхоза проводится при учете данных анамнеза (присутствие в рационе сырой или недостаточно проваренной речной рыбы), результатов клинического осмотра (желтушность, кахексия, асцит, нарушение функционирования желудочно-кишечного тракта) и лабораторных и, если требуется, инструментальных исследований. При наличии симптомов (основной – желтушность), причиной которых может быть описторхоз, необходимо гельминтологическое исследование кала (проводится по специальной методике, пригодной для диагностики описторхоза), однако яйца паразита могут быть обнаружены далеко не во всех случаях, и нередко точный диагноз ставится только по результатам вскрытия.
Также выполняются общий и биохимический анализы крови, в последнем может быть отмечено повышение уровней аланинаминотрансферазы, аспартатаминотрансферазы, щелочной фосфатазы, билирубина. При асците необходимо проведение цитологического и биохимического анализа выпотной жидкости (наличие выпота в брюшной полости может быть оценено при помощи рентгенографии).