В большинстве случаев кандидоз проявляется поражениями слизистых оболочек и кожи. На слизистых оболочках отмечают образование характерных «бляшек», покрытых сероватым или белым налетом (наиболее частое место локализации – ротовая полость). Поражения кожи характеризуются изъязвлениями, возможно, без серовато-белого налета, похожими на таковые при многих других заболеваниях кожи, в том числе аутоиммунных (например, при системной красной волчанке, или диссеминированной эритематозной волчанке). Нередко при кандидозе отмечают поражение кожно-слизистых зон.
Локализация повреждений кожи – вокруг рта (губы), глаз, ушей (или внутри ушной раковины, что является причиной хронического рецидивирующего отита), ануса, у кошек – на лапах. Помимо этого, при увеличении численности колоний дрожжевых грибков в желудочно-кишечном тракте, может присутствовать диарея. Хронический цистит является еще одним возможным осложнением кандидоза. Его симптомами служат затрудненное болезненное мочеиспускание (малыми порциями, но часто), присутствие крови в моче.